Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms