Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phldb3E9QAF4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phldb3E9QAF4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms