Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5407E9Q7Q1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5407E9Q7Q1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms