Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Simc1E9Q6E9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Simc1E9Q6E9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Simc1E9Q6E9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms