Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn2r56E9Q4U5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Vmn2r56E9Q4U5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Vmn2r56E9Q4U5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Vmn2r56E9Q4U5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Vmn2r56E9Q4U5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms