Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Zfp558E9Q1J0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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Zfp558E9Q1J0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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