Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Soga1E1U8D0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga1E1U8D0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms