Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21560D3Z7A4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21560D3Z7A4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms