Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms