Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf217D3YYI7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf217D3YYI7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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