Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce3B5KM66 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce3B5KM66 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms