Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11cB4XVP9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11cB4XVP9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms