Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp26c1B2RXA7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms