Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms