Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Zbed5B2RPU8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed5B2RPU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed5B2RPU8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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