Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtpruB1AUH1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtpruB1AUH1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtpruB1AUH1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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