Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube2uB1AUC4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2uB1AUC4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2uB1AUC4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms