Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spocd1B1ASB6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spocd1B1ASB6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms