Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc9bA3KGF9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms