Protein–RNA interactions for Protein: A2AK42

Gm13697, Predicted gene 13691, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13697A2AK42 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm13697A2AK42 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm13697A2AK42 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms