Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Prdm12A2AJ77 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prdm12A2AJ77 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms