Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms