Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhbdl2A2AGA4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms