Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms