Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700023F06RikA2AB62 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700023F06RikA2AB62 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms