Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb4A2A863 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb4A2A863 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms