Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calcoco2A2A6M5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms