Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sppl2cA2A6C4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sppl2cA2A6C4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms