Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv30A0A0B4J1P1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv30A0A0B4J1P1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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