Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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