Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms