Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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