Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms