Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dkc1-201ENSMUST00000033776 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr59-203ENSMUST00000211981 3618 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-6-201ENSMUST00000103446 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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