Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Btn2a2-202ENSMUST00000110432 2089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Zfp42-203ENSMUST00000211248 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dpysl3-202ENSMUST00000118043 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cdk12-202ENSMUST00000107538 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Gm10398-201ENSMUST00000100826 397 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ccl3-201ENSMUST00000001008 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Rcan2-203ENSMUST00000177857 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Ccr6-206ENSMUST00000180103 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cd209a-203ENSMUST00000207979 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Fcer2a-207ENSMUST00000208492 1053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 Hacl1-201ENSMUST00000022437 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Znf48Q3US17 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dpf3-207ENSMUST00000178756 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Htr2b-201ENSMUST00000027431 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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