Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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