Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 4930534H03Rik-201ENSMUST00000216311 1669 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms