Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
GcsamQ6RFH4 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GcsamQ6RFH4 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms