Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 St6gal1-206ENSMUST00000178797 4177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Acpp-202ENSMUST00000112590 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Prkar1a-203ENSMUST00000106677 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms