Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

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Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm43280-201ENSMUST00000202958 1550 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 A230059L01Rik-201ENSMUST00000126596 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 AC165260.6-201ENSMUST00000225447 1735 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm44317-201ENSMUST00000204314 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Pla2g2c-202ENSMUST00000105808 3448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm4890-201ENSMUST00000181030 3784 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm20712-201ENSMUST00000176387 1491 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Zfp551-202ENSMUST00000120220 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Cd99l2-203ENSMUST00000114586 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Sept2-214ENSMUST00000172165 3192 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Dync1i2-207ENSMUST00000112142 2585 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Col8a1Q00780 8430436N08Rik-201ENSMUST00000129988 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Col8a1Q00780 Cdk15-202ENSMUST00000160662 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Col8a1Q00780 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Col8a1Q00780 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Plp1-202ENSMUST00000113085 2540 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm6733-201ENSMUST00000118302 1920 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Slc30a6-202ENSMUST00000179074 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Dpf3-207ENSMUST00000178756 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Tacr3-201ENSMUST00000029822 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Cldn1-201ENSMUST00000023154 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col8a1Q00780 Gatb-204ENSMUST00000127348 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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