Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Sh3bp1P55194 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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Sh3bp1P55194 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Sh3bp1P55194 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sh3bp1P55194 Msr1-201ENSMUST00000026021 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sh3bp1P55194 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sh3bp1P55194 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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