Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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