Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms