Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CcniQ9Z2V9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CcniQ9Z2V9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CcniQ9Z2V9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CcniQ9Z2V9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CcniQ9Z2V9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CcniQ9Z2V9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms