Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
D17h6s53eQ9Z1R4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms