Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgr5Q9Z1P4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms