Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo3Q9Z172 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo3Q9Z172 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms