Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo1Q9Z132 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms