Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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Sh3bp5Q9Z131 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
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Sh3bp5Q9Z131 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5Q9Z131 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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