Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NgfrQ9Z0W1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms